Palírna Tomatin byla založena v r. 1897 skupinou podnikatelů z Inverness sdružených v The Tomatin-Spey District-Distillery Co. V r. 1906 tato společnost zbankrotovala, ale již v r. 1909 vznikla Tomatin Distillers Co Ltd a obnovila provoz palírny. V letech 1956-1974 prošla palírna několika rekonstrukcemi, které z ní udělaly největší skotskou palírnu whisky (23 kotlů, kapacita výroby 12 miliónů litrů ročně). V r. 1986 se palírna stala majetkem japonské společnosti Takara, Shuzo & Okura. V současné době palírna pracuje asi na polovinu svého výkonu a většina vyrobeného destilátu se používá do míchaných whisky společnosti Big T, Antiquary a Talisman. Jako single malt se Tomatin stáčí především ve věku 12 let, aůe poslední dobou došlo k výraznmurozšíření věkového portfolia.