Současná palírna Clynelish byla založena v r. 1967 (do provozu uvedena 1969), ale dlouhá léta před tím (od r. 1819) toto jméno patřilo palírně dnes zvané Brora, která je od r. 1983 mimo provoz (pravděpodobně natrvalo). Nová palírna Clynelish je třikrát větší než původní a kopíruje palírnu Caol Ila (obě patří společnosti United Distillers). Pouhé 1% produkce se stáčí jako single malt, zbytek se používá do míchané whisky Johnnie Walker Black Label.